オミクロンはデルタより入院率が低いことを報告する3つの論文


Severity of Omicron variant of concern and vaccine effectiveness against symptomatic disease: national cohort with nested test negative design study in Scotland

概要
背景
2021年11月にアフリカ南部で発生したSARS-CoV-2オミクロン懸念変異株(VOC)は、急速に世界中に広がっている。オミクロンについては、特にその重症度と既存のワクチンがCOVID-19の予防にどの程度有効であるかに関連して、多くの未解決の問題が残っている。

研究方法
540万人(人口の99%)のプライマリケア、ワクチン接種、逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)、シークエンス、入院、死亡のリンクデータからなるスコットランド全体のEarly Pandemic Evaluation and Enhanced Surveillance of COVID19 (EAVE II) プラットフォームを用いて、試験陰性デザインのインシデントケースとコホート分析を実施し、Covid19の発症と死亡について調べた。

2021年11月1日から12月19日までの期間を対象とした対照研究により、オミクロンの重症度と有症状疾患に対するワクチン効果(VE)の初期推定値を提供する。デルタとオミクロンのVOCの代替指標としてS遺伝子の状態を用い、S遺伝子陽性はデルタを示し、S遺伝子陰性はオミクロンを示すとした。Cox比例ハザードモデルを用いて,年齢,性別,社会経済的状況,ワクチン接種状況,臨床的危険因子を調整したCOVID-19入院のリスクを推定した。一般化加法ロジスティック回帰モデルを用いて、年齢と性別のスプライン項を設定し、2回目のワクチン接種後25週間以上経過した時点でのVEを推定した。

所見
2021年11月23日、スコットランドでウイルス配列決定により確認されたオミクロンの最初の症例が記録された。 2021年12月19日までに、23,840件のS遺伝子陰性症例が存在した。これらのS遺伝子陰性症例は、20~39歳の年齢層に多くみられた(11,732人、49.2%)。再感染の可能性があるS遺伝子陰性例の割合は、S遺伝子陽性例の10倍以上であった(7.6%対0.7%)。S遺伝子陰性者の入院は15例であり,調整後の観察/予想比は0.32(95%CI 0.19,0.52) であった。3回目/ブースターワクチン投与は、2回目投与後25週間以上と比較して、S遺伝子陰性の症候性感染リスクを57%(95%CI 55, 60)減少させた。

解説
これらの初期の国内データは、オミクロンはデルタと比較して、COVID-19による入院のリスクを3分の2に減少させることを示唆している。デルタに対する最大の防御を提供する一方で、3回目のワクチン接種/ブースター投与は、2回目のワクチン接種後25週間以上と比較して、オミクロンの症候性COVID-19のリスクに対する実質的な追加防御を提供する。

https://www.research.ed.ac.uk/en/publications/severity-of-omicron-variant-of-concern-and-vaccine-effectiveness-

Report 50 – Hospitalisation risk for Omicron cases in England

概要
オミクロン変異型(1)とデルタ変異型の入院リスクの違いを評価するために、イングランドで最終検体が12月1日から14日の間にPCRで確認されたすべてのSARS-CoV-2症例からデータを解析した。変異株は、S-gene Target Failure (SGTF) と遺伝子データを組み合わせて定義した。症例データは、National Health Service(NHS)番号により、National Immunisation Management System(NIMS)データベース、NHS Emergency Care(ECDS)および Secondary Use Services(SUS)病院エピソードデータセットにリンクされた。病院への入院は、最後のPCR検査陽性から14日以内に、その日を含めて病院に出席した記録と定義された。二次分析では、入院日数が1日以上である通院のサブセットを調べた。層別条件付きポアソン回帰を用いて、年齢、性別、民族、地域、検体採取日、多重剥奪指数、一部の分析ではワクチン接種状況によって定義される人口統計層で、入院状況を予測した。予測変数は,変異型(オミクロン型またはデルタ型),再感染状況,ワクチン接種状況であった。

全体として、調査期間中の全症例を平均すると、デルタ感染に比べ、オミクロン感染では入院リスクが低下するというエビデンスを見出した。減少の程度は、症例と入院に使用した包含基準に依存し、すべての入院をエンドポイントとした場合は20~25%、1日以上の入院またはECDS退院欄に「入院」と記録された入院をエンドポイントとした場合は40~45%の範囲であった(表1)。これらの低減は、ワクチン接種と自然感染の両方によって提供される防御力が低下するため、オミクロンの感染リスクの大きさと釣り合う必要がある。感染歴があると、入院のリスクは約50%減少し(表2)、1日以上の入院のリスクは61%(95%CI:55-65%)減少する(再感染を十分に確認するための調整前)。

オミクロンの過去の感染率と再感染率が高いことから、オミクロンとデルタの重症度の本質的な違いを正確に定量化し、過去の感染による防御を評価するために、ハザード比推定値を修正する必要があることがわかる。その結果、調整は中程度(オミクロンとデルタのハザード比の増加は通常0.2未満、再感染と一次感染のハザード比は約0.1減少)であるが、全体として重症度の評価には重要である。入院日数1日以上をエンドポイントとした場合,再感染例と一次感染例の相対リスクの調整推定値は0.31となり,入院リスクが69%減少した(表2)。

入院リスクをワクチン接種の有無で層別すると、層別していない解析と一致するものの、より複雑な全体像が明らかになった。アストラゼンカ(AZ)ワクチンとファイザーまたはモデルナ(PF/MD)ワクチンの一次接種(1回目と2回目)の間に明らかな差があることが示された。PF/MDのオミクロンによる通院ハザード比は,これらの接種カテゴリーにおけるデルタのハザード比と同様であり,オミクロンのハザード比はAZ接種カテゴリーではデルタより概して低かった。サンプル数が限られているため、これらの傾向を過剰に解釈することには注意が必要であるが、AZによる軽度の感染に対する保護はデルタの緊急接種により大幅に減少したが、より重篤な結果に対する保護は維持されているというこれまでの知見と一致している(2,3)。PF/MDはAZよりもオミクロンで症状性感染に対して高い効果を維持していることから(4)、通院に対する正味のワクチン効果はワクチン間で差がない可能性があることを強調しておく。

今回の推計は、ヨーロッパに広がるオミクロンの波による潜在的な医療需要に関する数理モデルを改良するのに役立つだろう。表3に示したハザード比は、感染に対する有効性の推定値(4)から、入院に対するワクチンの有効性(VE)の推定値に変換することが可能である。大まかには、少なくとも2回のワクチン接種を受けた人は、オミクロンの変異型に対して感染に対する防御が大きく失われたとしても、入院に対して実質的に防御されていることを示唆している(4,5)。

https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/covid-19/report-50-severity-omicron/

Early assessment of the clinical severity of the SARS-CoV-2 Omicron variant in South Africa

背景
2021年11月に南アフリカでSARS-CoV-2 Omicron variant of concern(VOC)が他の変異株にほぼ完全に取って代わり、COVID-19患者の急増と関連した。我々は、Thermo Fisher Scientific TaqPath COVID-19 PCRテストにおけるS Gene Target Failure(SGTF)を代理として、オミクロンに感染した個体の臨床的重症度を評価することを目的とした。

方法
(i) SARS-CoV-2検査室検査、(ii) COVID-19症例データ、(iii) ゲノムデータ、および (iv) 南アフリカ全体のDATCOV全国病院監視システムのデータリンクを行った。Thermo Fisher TaqPath COVID-19 PCRを用いて同定された症例については、感染をSGTFまたは非SGTFとした。10月1日から11月30日の間に診断されたSGTF感染者と、(i)同期間の非SGTF、および(ii)2021年4月から11月に診断されたデルタ感染を比較する多変量ロジスティック回帰モデルを用いて、疾患の重症度を評価した。

結果
2021年10月1日から12月6日までに、全国で161,328例のCOVID-19が報告され、38,282例がTaqPath PCRで検査され、29,721例のSGTF感染が特定された。SGTF感染の割合は、10月上旬(39週目)の3%から12月上旬(48週目)の98%に増加した。多変量解析では,入院に関連する因子を制御した後,SGTF 感染者は非 SGTF 感染者に比べて入院する確率が低かった(調整オッズ比(aOR)0.2,95%信頼区間(CI)0.1~0.3)。入院患者において,重症化に関連する因子を制御した後,重症化のオッズは,同時期に診断された非 SGTF 感染者と比較して SGTF 感染者で差がなかった(aOR 0.7,95% CI 0.3~1.4)。初期のデルタ感染と比較すると、重症化に関連する因子を制御した後、SGTF感染者は重症化のオッズが低かった(aOR 0.3、95%CI 0.2-0.5)。

結論
初期の解析では、同時期の非SGTF感染者と比較して、SGTF感染者における入院のリスクが低下していることが示唆された。入院後の重症化リスクはSGTF感染者と非SGTF感染者で同程度であったが、SGTF感染者は初期のデルタ感染者と比較して重症化リスクが減少していた。この減少の一部は、高い集団免疫の結果であると考えられる。

https://doi.org/10.1101/2021.12.21.21268116

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